片段长度差异等位基因特异性PCR——一种改良的SNP分型新方法     被引量：27

A Simple and Rapid Modified-New Method for SNP Typing by Fragment Length Discrepant Allele Specific PCR

中文题名：片段长度差异等位基因特异性PCR——一种改良的SNP分型新方法

作者：黄代新 杨庆恩 赵贵森

第一作者：黄代新

机构：[1]华中科技大学同济医学院法医学系,湖北,武汉,430030

年份：2005

卷号：21

期号：1

起止页码：11-14

中文期刊名：法医学杂志

中文关键词：单核苷酸多态性;片段长度差异等位基因特异性PCR;碱基错配;法医物证检验学;

摘要：目的建立一种基于等位基因特异性PCR原理的改良SNP分型新方法:片段长度差异等位基因特异性PCR,并考察特异性引物的3'端第3位、第4位碱基错配对特异性延伸的影响.方法以SNP位点rs759117和rs760887为例,设计两条长度不同、3'末端分别与SNP两个等位基因碱基配对的上游引物,同时在两个等位基因特异性引物3'端第3或第4位碱基引入错配以增加特异性,下游为公用引物.PCR产物经聚丙烯酰胺凝胶电泳、银染显带后确定样本的基因型.结果不同SNP纯合子为长度不同的单一谱带,杂合子则为两条带,其结果与直接测序完全一致.两条特异性上游引物3'端第3或第4位碱基引入错配后非特异性延伸显著减少,且对PCR反应条件的严格性要求明显降低.结论片段长度差异等位基因特异性PCR是一种简单快速而有效的SNP分型新方法;两条特异性引物3'端第3、第4位碱基引入错配可使特异性显著增加.

分类号：D919.2[法医物证检验学]

收录：化学文摘（网络版）;CSCD:【CSCD2011_2012】；生物医学检索系统;文摘与引文数据库;中国科技核心期刊;普通刊;