采用Identifiler系统判定消化系统肿瘤组织身源准则探讨 被引量:3
A Primary Study of Criterion for Source Identification of Gastrointestinal Tumor Sample with Identifiler Multiplex System
中文题名:采用Identifiler系统判定消化系统肿瘤组织身源准则探讨
第一作者:赵书民
机构:[1]司法部司法鉴定科学技术研究所上海市法医学重点实验室,上海200063
年份:2011
卷号:27
期号:2
起止页码:102-106
中文期刊名:法医学杂志
中文关键词:法医遗传学;肿瘤;STR;变异;个体识别;
摘要:目的探讨采用Identifiler系统进行消化系统肿瘤组织身源判定时共有等位基因数(IAn)和全相同基因座数(A2)的标准。方法在对105对消化系统肿瘤组织-身源正常组织对进行Identifiler系统分型的基础上,依据IAn和A2的有限分布原则,将IAn的16种取值代入已建立的相应判别函数,通过Fisher判别准则确定采用IAn和A2能够判定消化系统肿瘤组织身源的最小值。依据这一标准,对105对消化系统肿瘤组织-身源正常组织对进行判定,计算该标准甄别肿瘤身源者与无关个体、肿瘤身源者与其全同胞的敏感度、特异性、准确度、阳性预测值和阴性预测值,通过Kappa检验比较基于IAn和A2的判定标准与金标准的一致性。结果消化系统肿瘤组织中STR基因座基因型变更(STRGA)的检出率为5.46%,至少出现1个STRGA基因座者占31.43%。依据Fisher判别准则,当满足标准Ⅰ(IAn≥23且A2≥8)时可甄别肿瘤身源者与无关个体,当满足标准Ⅱ(IAn≥26且A2≥11)时可甄别肿瘤身源者与其全同胞。上述标准甄别相应关系时准确度均为0.9710,阳性预测值均为1.0000,阴性预测值均为0.8919。一致性检验显示上述标准对肿瘤组织身源的判定结果与金标准判定结果的Kappa值均为0.9235。结论采用Identifiler系统进行消化系统肿瘤组织身源判定时,标准Ⅰ和标准Ⅱ可分别用以甄别肿瘤身源者与无关个体和肿瘤身源者及其全同胞。
分类号:DF795.2[法医物证检验学]
收录:化学文摘(网络版);CSCD:【CSCD2011_2012】;生物医学检索系统;文摘与引文数据库;中国科技核心期刊;普通刊;