以CE-PCR产物为模板的STR序列多态分型方法     被引量：1

Sequence-based STR genotype of the CE PCR products

中文题名：以CE-PCR产物为模板的STR序列多态分型方法

作者：郭立亮 吴浩 刘宗伟 龚辰宇 张驰 康克莱 韦美甜 孙宏钰 季安全 王乐

第一作者：郭立亮

机构：[1]中山大学中山医学院法医学系,广东广州5100891;[2]现场物证溯源技术国家工程实验室,法医遗传学公安部重点实验室,公安部物证鉴定中心,北京100038;[3]江苏省常熟市公安局,江苏常熟215500;[4]昆明医科大学法医学院,云南昆明650500

年份：2021

卷号：36

期号：3

起止页码：263-268

中文期刊名：中国法医学杂志

中文关键词：法医遗传学;二代测序;短串联重复序列;序列多态性;毛细管电泳扩增产物;

摘要：目的实现以荧光标记复合扩增产物为扩增模板的STR序列多态分型。方法筛选常用STR分型试剂盒基因座并设计引物,构建常染色体STR复合扩增体系。分别以毛细管电泳(CE)试剂盒GlobalFilerTM、PowerPlex?21和IdentifilerTM Plus的扩增产物为模板,扩增、建库测序及数据分析,评估体系分型准确性及对CE扩增产物的通用性,并与Precision ID GlobalFilerTM NGS STR Panel体系进行比较。结果该复合扩增体系能够从3款CE试剂盒的扩增产物中获得所有基因座的正确分型和序列多态信息,其体系均衡性和杂合子均衡性亦良好,且均优于Precision ID体系。结论该复合扩增体系建立了CE技术与二代测序技术之间的桥梁,实现了检材的零利用,能够进一步挖掘荧光标记扩增产物的STR序列多态信息,是对现有技术的提升和有效补充。

分类号：DF795.1[法医基础科学]

收录：CSCD:【CSCD_E2021_2022】；医学文摘;日本科学技术振兴机构数据库;文摘与引文数据库;中国科技核心期刊;普通刊;