中文题名:微单倍型遗传标记的法医基因组学研究
作者:李茜 王浩宇 曹悦岩 朱强 舒潘寅 侯婷芸 王雨婷 张霁
第一作者:李茜
机构:[1]四川大学华西基础医学与法医学院,成都610041
年份:2021
卷号:43
期号:10
起止页码:962-971
中文期刊名:遗传
中文关键词:法医遗传学;微单倍型;千人基因组计划;中国南方汉族群体;
摘要:微单倍型(microhaplotype,MH)是在一定DNA片段范围之内,由至少两个单核苷酸多态性位点组成的遗传标记。MH兼具无stutter伪峰、多态性丰富以及扩增子较小等特点,有望成为法医学上的一种新型遗传标记。为了从全基因组维度上分析MH的特征,进一步发掘其应用潜能,本研究基于千人基因组计划中105个中国南方汉族个体的全基因组测序数据,构建了迄今为止最全面的MH数据集。结果表明,人类基因组中350 bp范围之内的MH位点数量共计9,490,075个,且微单倍型分布密度对染色体变异水平具有提示作用。从多种碱基跨度范围对MH的多态性分析表明,其多态性潜能可达到或者超过常用短串联重复序列位点的水平。此外,本文归纳总结了MH组装灵活等特点,并提出了构建微单倍型数据库的方案。
分类号:D91[法学各部门]
收录:BDHX:【BDHX2020】;农业与生物科学研究中心文摘;化学文摘(网络版);CSCD:【CSCD2021_2022】;医学文摘;日本科学技术振兴机构数据库;生物医学检索系统;RCCSE;文摘与引文数据库;WOS:【哥白尼索引】;中国科技核心期刊;核心刊;