基于大鼠心肌组织mRNA表达谱筛选冠状动脉性猝死相关生物标志物    

Screening Biomarkers of Sudden Coronary Death Based on mRNA Expression Profile of Rat Myocardial Tissues

中文题名：基于大鼠心肌组织mRNA表达谱筛选冠状动脉性猝死相关生物标志物

作者：郭相杰 李昊 白雅琴 吴鹏 赵春梅 董祎铭 陈念念 贠克明 高彩荣

第一作者：郭相杰

机构：[1]山西医科大学法医学院,山西晋中030600

年份：2022

卷号：38

期号：4

起止页码：443-451

中文期刊名：法医学杂志

中文关键词：法医病理学;冠状动脉性猝死;信使RNA;差异表达基因;生物标志物;心肌缺血;死亡原因;大鼠;

摘要：目的探寻冠状动脉性猝死(sudden coronary death,SCD)大鼠心肌组织信使RNA(messenger RNA,mRNA)的差异表达,为SCD的法医学鉴定提供思路。方法建立SCD大鼠模型,利用二代测序技术进行转录组测序;用R软件limma包筛选SCD大鼠心肌组织中差异表达基因(differentially expressed gene,DEG),使用STRING数据库及Cytoscape 3.8.2软件对DEG构建蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络,并基于cytoHubba插件筛选相关hub基因。用R软件clusterProfiler包对筛选到的DEG进行生物学功能和信号通路富集分析。结果共有177个DEG与SCD相关,主要参与肾素-血管紧张素系统、PI3K-Akt信号通路等。血管紧张素原(angiotensinogen,AGT)、补体成分4a(C4a)、Fos原癌基因(Fos proto-oncogene,FOS)等基因在SCD的发生发展过程中发挥关键作用。结论AGT、C4a、FOS等基因有望成为鉴定SCD的潜在生物标志物,基于mRNA表达谱的研究可为SCD的法医学鉴定提供参考。

分类号：DF795.1[法医基础科学]

收录：化学文摘（网络版）;CSCD:【CSCD_E2021_2022】；医学文摘;日本科学技术振兴机构数据库;生物医学检索系统;RCCSE;文摘与引文数据库;中国科技核心期刊;普通刊;